L'edificio sorge in un sito un tempo caratterizzato dalla presenza di una chiusa, costruita dalla Serenissima nel 1500.
La chiusa, di grande importanza per il sistema idroviario del Veneto meridionale e delle regioni limitrofe, consentiva la navigazione fra il fiume Po di Venezia ed il Canalbianco e quindi (attraverso il sistema Po di Levante, Po di Brondolo e Canale di Valle) permetteva il collegamento con la Laguna Veneta.
L'ala ovest dell'edificio si è mantenuta quasi inalterata dall'epoca di costruzione, risalente presuribilmente al 1840 e si tratta dell'unico manufatto superstite del complesso edilizio sorto a servizio della conca, che comprendeva la dogana, il magazzino idraulico, la caserma delle guardie, ecc..